植物萬(wàn)用RNA提取實(shí)驗方案

2013-12-18 09:44:39    作者:何嬙     來(lái)源:生物通     瀏覽次數:

  生物通報道在遺傳學(xué)研究中,科研人員廣泛地利用RNA來(lái)研究不同生物體的基因表達模式。通過(guò)了解生物體中RNA的種類(lèi)和數量,可以知道哪些基因獲得了表達,從而得到一些負責特定表型的基因的新見(jiàn)解。

  許多的工具,例如新一代測序和定量PCR,都可用于研究基因表達。但這些工具依賴(lài)于從目的生物體中抽提到高質(zhì)量的RNA,這可能是一項挑戰性的任務(wù)。相比于基因組DNA,RNA更微弱,容易發(fā)生降解。此外,許多的植物組織中充滿(mǎn)了阻礙分離足夠數量和/或質(zhì)量RNA的淀粉、纖維或抑制分次生化合物。

  盡管已有大量的RNA抽提方案開(kāi)發(fā)出來(lái),但其中大部分都是植物特異性的,許多是針對特定的作物或是模式生物(如擬南芥),對于構成絕大多數植物多樣性的非模式植物種類(lèi),這些方法的應用有點(diǎn)受限。

  來(lái)自加州大學(xué)伯克利分校的研究人員開(kāi)發(fā)出了一種適用于所有陸生植物(包括30萬(wàn)物種)的RNA提取新方案。

  根據研究的資深作者、加州大學(xué)伯克利分校植物和微生物學(xué)系副教授ChelseaSpecht所說(shuō),這一實(shí)驗方案將大大推動(dòng)非模式植物物種以RNA為基礎的研究。

  “采用這一實(shí)驗方案,我們可以從跨越陸生植物多樣性的植物所有類(lèi)型的組織中,成功地提取出高產(chǎn)量和高質(zhì)量的RNA,其中包括難以采用機械方法進(jìn)行碾磨,富含淀粉或是充滿(mǎn)次生化合物的組織。”

  論文的主要作者Roxana Yockteng、Specht和同事們在多種陸生植物種類(lèi)(包括1種苔蘚植物、3種裸子植物和很多的被子植物)以及不同的組織類(lèi)型(例如葉子、花和球果等)中測試了這一方案。他們能夠從測試樣品中始終如一地獲得大量高質(zhì)量的RNA。

  Specht說(shuō),這一實(shí)驗方案極其靈活可變;可以輕易地修改實(shí)驗方案中的許多步驟,從而適應植物化學(xué)和結構的改變。

  “無(wú)論你在哪個(gè)實(shí)驗室或是正在研究哪種植物,你都可以微操控你的RNA提取方案,為自己做出一些小的改變。”

  這一實(shí)驗方案的最后還包括一個(gè)選擇性的凈化步驟,使得可以從有問(wèn)題的樣本(例如富含木質(zhì)素或是次生代謝產(chǎn)物)中獲得高質(zhì)量的RNA,且不會(huì )造成RNA量的顯著(zhù)損失。這一步驟是對一種凈化DNA的類(lèi)似方法進(jìn)行修改而成。

  Specht說(shuō),新實(shí)驗方案可廣泛應用于植物遺傳研究中。與RT-PCR、定量PCR或RNA測序(轉錄組分析)有關(guān)的基因表達研究均可以采用這一實(shí)驗方案來(lái)提取必要的高質(zhì)量RNA。此外,研究人員可以利用新一代測序生成的轉錄組,開(kāi)發(fā)出用于系統發(fā)生和植物地理學(xué)研究的靶序列捕獲標簽。

  Specht說(shuō),能夠將這一實(shí)驗方案應用于大量的植物和組織種類(lèi),還將有助于對各種譜系的轉錄組進(jìn)行比較分析,使得研究人員能夠對各種有趣的進(jìn)化問(wèn)題開(kāi)展調查。此前這是一個(gè)挑戰,因為現有的實(shí)驗方案在跨越多種系統發(fā)生分歧物種中應用時(shí),通常太具分類(lèi)群特異性或組織特異性。

編輯:zhaojun

凡注明“風(fēng)景園林網(wǎng)”的所有文章、項目案例等內容,版權歸屬本網(wǎng),未經(jīng)本網(wǎng)授權不得轉載、摘編或利用其它方式使用上述作品。已經(jīng)本網(wǎng)授權者,應在授權范圍內使用,并注明“來(lái)源:風(fēng)景園林網(wǎng)”。違反上述聲明者,本網(wǎng)將追究其相關(guān)法律責任。

相關(guān)閱讀

英研究人員首次在植物中發(fā)現稀有礦物

  近日,英國劍橋大學(xué)的研究人員在國際上首次發(fā)現一些虎耳草屬(Saxifraga)高山植物的葉片可以產(chǎn)生稀有礦物球霰石,相關(guān)研究結果發(fā)表在《植物志》上。【詳細】

生動(dòng)綠意場(chǎng)景:家庭微景觀(guān)設計

  一株綠色植物能為家居注入新鮮的氣息,而現在的綠色植物景觀(guān)設計也愈發(fā)新奇多樣,在玻璃花瓶/花盆之中,什么樣的微型景觀(guān)都有可能出現。9款家庭微景觀(guān)設計,為家搭建一處生動(dòng)的綠意場(chǎng)景。【詳細】

植物與水的搭配讓景觀(guān)充滿(mǎn)詩(shī)情畫(huà)意

  在園林景觀(guān)設計中,水景不外乎動(dòng)景和靜景。一方靜水搭配靈動(dòng)叢生的植物,便多了幾分令人愉悅的生機。【詳細】

湖南永州將再添一個(gè)國家森林公園

今天,從國家林業(yè)局傳來(lái)喜訊,祁陽(yáng)縣創(chuàng )建太白峰國家級森林公園通過(guò)評審,這意味著(zhù)永州將再添一個(gè)國家森林公園。【詳細】

精品国产污污免费网站入口在线|中文字幕伊人精品|性色aV一区二区三区咪爱|久久天天躁夜夜躁狠狠85台湾|亚洲色播爱爱爱爱爱爱爱