目前已知的蕨類(lèi)植物葉綠體基因組在組織結構上表現為兩種基本類(lèi)型：一是核心型，高等核心薄囊蕨類(lèi)水龍骨目和樹(shù)蕨目具此類(lèi)型；另一是基部型，見(jiàn)于其他蕨類(lèi)基部類(lèi)群。與基部型相比，核心型葉綠體基因組的反向重復區和大單拷貝區的rpoB-psbZ區（BZ區）發(fā)生過(guò)復雜的基因組重排，同時(shí)它們還丟失了5個(gè)相同的tRNA基因。但是，處在這兩種類(lèi)型之間的中間演化類(lèi)型卻一直未被發(fā)現。

　　近日，在中國科學(xué)院“百人計劃”王艇研究員指導下，中科院武漢植物園高磊博士等人分別選取核心薄囊蕨的基部類(lèi)群異型孢子蕨目和其姊妹群海金沙目的代表植物南國田字草和海金沙，測定了它們葉綠體基因組的全序列。隨后，他們基于比較基因組學(xué)分析發(fā)現：南國田字草葉綠體基因組的組織結構與水龍骨目和樹(shù)蕨目基本一致，都表現為核心型；而海金沙的BZ區基因順序雖與基部型相同，但反向重復區卻與核心型一致，同時(shí)也丟失了5個(gè)相同的tRNA基因。據此確定，海金沙的葉綠體基因組組織方式代表的是蕨類(lèi)植物從基部型向核心型演化的過(guò)渡形態(tài)。

　　此外，該項研究還對ndhB基因兩外顯子進(jìn)化速率的異質(zhì)性做了分析，首次在基因內水平證明了反向重復區對葉綠體DNA序列進(jìn)化的限制作用。