三清殿重建于南宋淳熙六年（1197年），是蘇州僅存的一座南宋殿堂建筑，也是全國最大最古老的道觀(guān)殿堂之一。設計者是當時(shí)著(zhù)名畫(huà)家趙伯駒之弟趙伯肅。殿是重檐歇山式，屋脊高10余米，兩端有一對高約3.5米的南宋磚刻螭。殿闊44米，深25米。內有高大殿柱40根，左右山墻檐柱30根。屋面坡度平緩，出檐較深，斗拱疏朗宏大，特別是內部月亮式梁架上檐內槽斗拱的上昂做法，為國內首例。

　　殿內正中的磚砌須彌座，高1.75米，分上、中、下3層，系南宋遺物。座上供奉3尊高17余米泥塑的三清全身像，法相莊嚴，神采奕奕，雖經(jīng)重修，仍不失為南宋道教雕塑中的精品。殿前建有寬廣的青石砌成的露臺，三面都設有石欄與踏垛，石欄板上的浮雕人物、水族、鳥(niǎo)獸等，形態(tài)逼真，極為精美，相傳是唐、宋時(shí)代的作品。宏大雄偉的三清殿保持著(zhù)南宋的建筑特色，在我國建筑史上占有重要地位。